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现任领导
杨修群 (院长)
南京大学教授,博士生导师,大气科学学院院长。科技部973计划项目首席科学家,国家杰出青年科学基金获得者,首批新世纪百千万人才工程国家级人选,江苏省“333高层次人才培养工程中青年科技领军人才,南京大学高层次学科带头人(特聘教授)奖励计划入选者。
潘益农 (书记)
南京大学大气科学系党委书记,副教授。中国气象学会水文气象专业委员会委员
王 元 (副院长) 
南京大学大气科学学院教授,博士生导师。目前主要从事中尺度灾害性天气分析、预报和动力学研究、大气流体数值计算、网格计算优化理论和数据变分同化理论、中尺度大气数值模式、以及下垫面与大气相互关系物理过程的等领域相关研究。
孙鉴泞 (副院长) 
南京大学大气科学学院教授,博士生导师。科研工作主要从事大气边界层物理、大气环境、云和降水物理等方面研究。
王体健 (副院长)
南京大学大气学院教授,博士生导师,主要从事中小尺度大气环境模拟、大气化学与区域气候变化、大气沉降与土壤物质交换等方面的研究。担任南京大学大气科学学院本科教学管理工作。
喻春红 (副书记) 
1974年10月生,2009年入选南京大学青年管理骨干培养计划,2011年入选第一期南京大学青年管理干部境外研修计划并于2012年下半年赴英国谢菲尔德大学管理部门学习。曾获得校“优秀辅导员”、“优秀指导员”、“信息工作先进个人”等称号。